位于新疆乌鲁木齐市前进路15号，与西路军纪念馆相邻。最早修建于清朝，是全疆唯一一处保存完整的砖木结构清代庙宇式建筑群，文庙整体建筑占地2800平方米，建筑面积1000平方米，面阔三间，进深二间，有山门、前殿、大殿、两祖东、西厢房及钟楼、鼓楼。大成殿复原陈列有孔子像、四像、十二哲，各类祭器，《万世师表》《生民未有》等匾额，《孔子圣迹图》内容包括：孔子第子、孔子生平等。

1765－1767年清政府扩建乌鲁木齐城时，在后来的文化路（旧称文庙巷）建造了文庙。1884年新疆建省后，为纪念收复新疆的阵亡将士，遂在后前进路建造了昭忠祠，民国后改称忠烈祠。后将原文庙内的木质孔子牌位移此，忠烈祠改为文庙，既祭祀孔子，也祭祀道教“文昌帝君”。1922年，新疆都督杨增新进士自创“上帝教”，并将文庙改称“上帝庙”，1933年盛世才执政后，废止祭天祭孔，1944年，蒋介石将盛世才免职，任命吴忠信为新疆省主席，当年上帝庙复称文庙，次年大成殿落成后，废止祭天、专奉孔子。

1979年，文庙被列为市级文物保护单位，1988年国家拔款100万元进行了大规模翻建改造，在文庙内成立了乌鲁木齐市博物馆，2019年10月7日入选第八批全国重点文物保护单位名单。